安徽省已有26个县实现了新农合和城乡居民医保整合，占全省85个新农合统筹地区总数的30%。整合后的城乡居民医保均由当地卫生计生部门到记者发稿时止，安徽省已有26个县实现了新农合和城乡居民医保整合，占全省85个新农合统筹地区总数的30%。整合后的城乡居民医保均由当地卫生计生部门通过“一手托两家”的方式主管。
近年来，安徽省新农合已经实现了全部省内医疗机构及60余家省外医疗机构的即时结报;全省建立了新农合和医疗救助的统一服务平台;高血压等18组常见慢性病和再生障碍性贫血等9组特殊慢性病的门诊费用纳入了新农合报销。新农合通过设立一般诊疗费、门诊诊察费等，支持药品零差率政策的推行;实行按病种付费与临床路径相结合，推动城市医院改革;实施县域医共体试点，助推分级诊疗;通过建立向贫困人口倾斜的特殊补偿政策，助推精准扶贫等。
由于新农合制度的“比较优势”日益凸显，安徽省部分市县政府决心将城镇居民医保交给新农合统一管理。目前，该省已有26个县区将城镇居民医保合并到新农合，由卫生计生部门统一管理。整合后的城乡居民医保不仅节约了行政成本，而且统一了筹资标准、报销待遇，减少了城乡居民重复交费的负担，也减少了财政的重复支出。
安徽省农村合作医疗管理办公室主任夏北海说，卫生部门“一手托两家”，既管医保基金，也管医疗服务，可做到基金使用效率最大化和医疗服务质量最优化。