国管公积金和市管公积金主要区别有三个，第一个是管理单位不一样。根据国管与市管就能区分出你的单位是中央国家机关，国企还是地方国家机关和一般性企事业单位了。基本上国家公务员的公积金都是国管，地方省市公务员的公积金是市管，一般的企事业单位的也是市管。国企大多是国管。
第二个区别体现在公积金购房方面。贷款年限有很大差异。一般贷款年限的计算公式是房龄+贷款年限小于等于一个数值。这个数值，国管的要比市管的要大。也就是说，某些老房子，市管公积金贷不出来钱，国管的就可以的。
第三个区别，是我参考了其他人的答案，不能确定是否准确“两者主要的区别是公积金是否可以跨地区使用。
国管是公积金可以跨地区使用，如铁道部，是属于铁道部直管的，他们的单位工人的公积金是可以跨地区使用的。但不是企业可以选择国管还是直管的，要根据单位性质。
1、根据贷款人缴存公积金的地点（目前北京市公积金贷款主要分为市属公积金、国管公积金以及中直公积金，具体属于哪个，由贷款人向本单位负责公积金归集（缴存）的人确认，一般来讲，单位登记号为5的是国管。
2、客户的公积金缴存的哪个银行。一般情况，市属的缴存在交通银行。国管则是建设银行。
国管公积金额度的计算：国管公积金是根据客户提供收入证明进
行计算额度:收入是月供的2倍（收入证明必须是国管格式，且夫妻双方各开2份原件）
例：夫妻双方想贷80万，20年，收入证明要开到多少？
80X64.35X2=10296(10121.6/9737.6)也就是说客户夫妻双方税后收入必须开到10296以上。
夫妻双方税后收入为8500，想贷20年，最多能贷多少钱？
850064.352=66.04(67.18/69.83)，也就是说客户最多贷66万