深圳市新医保信息系统是行业内的一大创新，自上线以来引起不但为工作人员及客户提供了方便，同时也引起了行业内的关注，得到了行业内的认可。而在备受关注保障使用的同时深圳市相关部门内部也是一直在努力着。
为实现新医保信息系统与政策实现有序衔接，深圳市社保局多措并举，确保新医保信息系统已于2014年1月5日早上6：00正式上线运行。
1：加班备战，跟踪落实。为确保新医保信息系统上线运行后平稳过渡，信息中心和市社保局部分处室及分局工作人员元月4、5日利用周末双休时间，跟踪全市各定点医疗机构刷卡记账情况，并对新医保信息系统征收台账进行测试。截至目前新医保信息运行平稳。
2：制订方案，分步实施。为尽量减少给参保人就医刷卡带来的不便，信息中心分步组织实施新医保信息系统上线运行。第一步：即在1月2日至3日期间，先行暂停社保系统的部分业务，为新医保信息系统上线赢得时间，同时要求各业务处室，各分局做好对参保企业和参保人的解释工作;第二步：即在1月4日18：00至1月5日6：00期间，全市医保系统停用，将原有的信息数据导入新系统，确保新系统正式上线运行。
3：统一部署，协调合力。市社保局曾思克局长分别于2013年12月30日、2014年元月2日召开协调会。市人社局李滔副局长，市人社局信息中心，市社保局办公室、综合、计财、征收、养老、医保、工伤、失业处相关负责人参会。会上要求，各单位要高度重视，提前做好医保新信息系统上线的应急预案，并各司其职、齐心协力做好各项准备工作。
4：加强宣传，检查落实。市社保局通过在电台、报刊、微博及网站提前发布停机公告，同时要求全市各定点医疗机构张贴停机公告。市社保局医保工作人员还分赴各定点医疗机构检查落实情况，并要求各定点医疗机构在医保(含工伤医疗记帐)信息系统暂停记账功能期间，做好对参保人的解释工作，并提醒参保人先行现金支付医疗费用，待停机结束后，到所就医的定点医疗机构按规定办理补记帐和退款手续。