随着经济和社会发展特别是城市化进程的进一步加快，大病医疗保险制度在经过近4年的实践检验后，也逐步暴露出一些不容忽视的问题：1、筹资标准较低，保障力度较弱。按2005年的筹资标准，区、镇、村三级补贴约每人每年70元，农民个人承担约3035元。财政按工作奖励经费补贴各区约人均23元，平均每人每年约100110元，这一筹资额约为城镇职工医保筹资额的1/10，因此其结报比例也相对较低。
全市农村大病医保结报比例平均仅在1520%左右，对解决农民看病难、看病贵，减轻农民负担等问题发挥的作用有限。2、筹资盘子逐年缩小、运作成本逐年提高。由于农村大病医保是以各区为单位自成体系进行运作的，大病医保政策也不尽统一，运作成本居高不下，基本保持在50万元/年左右。同时近年来由于城市化进程的加快推进，城镇社保扩面步伐进一步加快，市区各区农村大病医保呈现出参保率逐年上升，而参保人数大幅下降的趋势。3、管理运转模式有待进一步改进和完善。
农村大病医保启动时，各单位基本都采用的政府主导和市场化运作相结合的模式。在大病医保实施初期，引入保险公司进行专业化管理，对资金的安全运作和管理、医保制度的建立完善以及结报网络的建立等具有积极的意义和作用，但是由于保险公司的企业运作模式与政府工作的出发点是不尽相同的。当前随着国务院、省政府相继明确要求，各级政府要把建立农村新型合作医疗制度作为政府工作的一项重要内容来落实，如果继续采用现行的运转模式是不太合适的，而且对全市农村医保的可持续发展带来消极影响。华博雅结合自己工作实际，加强调研，从健全完善全市农村大病医疗保障制度工作出发，提出：1、加大投入，逐步提高大病医保结报比例。建立和完善农村大病医保制度是市政府确立的为民办实事项目之一和农村卫生事业改革的重要内容，也是当前社会主义新农村建设的重要内容。
按照农村大病医保筹资水平要达到人均150元左右，在不增加农民负担的前提下，就必须加大各级财政特别是市财政的投入力度。按市、区、镇三级各承担30%，村集体承担10%的比例进行筹资，从而进一步提高筹资标准，增加农民结报比例，更加有效地解决好农民群众看病难、看病贵的问题。2、加强统筹，进一步完善农村新型合作医疗制度。根据目前城区农村医保参保人数逐年大幅降低、各区运作成本居高不下的现实，市政府应进一步加大对农村医保的统筹力度，尽快建立市级统筹的农村大病医疗保险制度。进一步统一全市农村医保政策，归并管理结报网络、实行归口管理，在进一步降低运作成本的同时，扩大筹资盘子，提高农村大病医保资金运作的安全性。同时要采取措施逐步推进农村医保与城镇医保的接轨。3、规范运作、建立健全农村医疗保障体系。要建立以政府运作为主体的农村大病医疗保障体系。在推进和规范农村社区卫生服务建设的过程中，探索实行农村医疗卫生服务收费政府指导价和以政府为主开展农村医疗救助工作，切实降低农民看病费用，减轻农民负担。同时要尽快恢复和建立区级农村合作医疗制度，充分分散农民的健康风险，并有效解决农民的基本医疗问题。