据遂昌县中医院介绍，该院综合改革的基本做法为：实行医院总控药品目录包括中成药在内总共为1000个品种以内，其中配备浙江省规定的457个品种基本药物占60%以上，这些药品（含中成药）实行零差率销售，基本药物销售额占药品收入总额不低于30%。并要求降低药品在医疗中的使用比例，医院配备抗菌药物在35个品种以内，住院抗菌药物使用率不超过60%，门诊不超过20%。
同时，实施经省物价部门同意的医药价格调整方案。增设一般诊疗费（含药事服务费），取消挂号费、诊查费，适当调高手术费、治疗费、护理费和住院床位费，对检验费、检查费、大型仪器治疗费等不予调整。经测算，该院调整部分医疗服务收费后，门诊和住院均次费用将有所下降。而且，增设的一般诊疗费和调整的医疗服务收费项目全部纳入医保报销甲类项目，直接降低了患者就医成本。
为严格控制医院医药费收入不合理增长，遂昌县中医院确定近期3年实现门诊、出院人次均次费和住院床日费用三个零增长目标，还提出今年门诊均次费比上一年下降10%。社保部门和中医院联动改革医保经费支付方式，对基本医保住院费用实行总额预算，按照剔除违规，按月结付，节约共享，超支分担的原则，以前三年医保住院费用为基础，切实核定县中医院医保患者住院费用年度预算总额，产生的医保费用风险由医院和社保部门共担。
记者采访中了解到，该院此次综合改革，一方面建立起经济运行新机制，将医院补偿由服务收费、药品加成收入和政府补助三个渠道改为服务收费和政府补助两个渠道，药品零差率销售后的收入减少，由调整部分医疗服务价格、政府补偿和医院努力节约成本来补足，充分体现公立医院的公益性。另一方面，促使医院进一步加强内部管理。医院无法从药品中获得利润后，促使医院通过努力提升医疗质量、服务能力和服务水平去扩大服务业务成果。为此，该院推出了系列配套改革，如推出引进紧缺人才、强化卫技队伍建设新举措，探索充分调动医务人员积极性的绩效考核新办法，增设便民惠民服务新项目等。
遂昌县卫生局局长杨全俊对记者说，新医改给中医医院的发展带来了新的机遇。他解释说，财政补助主要用于医院基本建设和大型设备购置，并对中医药发展的投入予以倾斜。遂昌县中医医院党委书记巫智强告诉记者，医院的业务收入结构改变后，促使医院和医生更加主动利用中医非药物治疗手段；为节省医疗成本，必将促使努力扩大收费低，疗效好的中医药服务，有利于提高中治率。