江苏、上海、浙江和安徽三省一市由于处于相对发达的南方地区，有着较相近的社会资源环境和国民收入水准，在沪、杭两地已经有过类似的探索和实践的基础上，最终将实现长三角三省一市基本医疗保险制度对接，并不令人感到意外。
但客观地说，其模式和做法目前尚不具备向全国全面推行的可行性。众所周知，跨省、区医保互认和对接，最大的障碍和阻力在于省、区或不同统筹区间的利益分配问题。目前，各省经济发展水平很不均衡，南方一些省市年人均国民收入已远远突破3200余美元，甚至已高达七八千美元，而北方部分欠发达地区年人均收入低者仅数百美元。按照国务院有关规定，基本医疗保险费由用人单位和职工共同缴纳。
用人单位缴费率应控制在职工工资总额的6％左右，职工缴费率一般为本人工资收入的2％。同样的比例放在不同的地区，高者个人年缴纳达上千元，而欠发达地区个人缴纳才不到百元。即便发达地区发扬奉献精神意识再强，但差距过大的统筹基础之下，越是发达省份吃的亏越大，甚至有可能出现欠发达地区医保费用近乎于让发达省份买单的尴尬局面。这种现实窘境之下，必然导致省和区之间医保对接壁垒重重。
跨省、区医保互认对接，本身也需要不菲的投入。以已推行市与市医保对接的上海和杭州为例，仅专网建设、设备添置和管理软件开发调整也产生了一笔不菲的费用，每年的网络单向租用费用就在10万元左右。这笔费用谁来承担？从哪部分财政收入中列支？发达地区还好些，贫困地区却未必能承担得起。另外，医保互认以及可以合并计算缴费年限，表面上仅仅是个人账户和统筹账户认可对接的问题，其实没有那么简单。医保出口最终将涉及医院方和基本医疗药物报销品类问题，医疗保险结算十分复杂，涉及到起付线、自付比例、封顶额度等等，例如上海的医疗保险药品目录就有1400余种，更有多如牛毛的一次性耗材、诊疗项目等。省际、区际定点医院之间，在医药费用报销上政出多门、号令不一，在无法尽快达到一致的情况下，将是各省间推行医保互认制度的巨大障碍。