在园在校学生办理首次参保手续，先通过学校(协办单位)上传学生信息。上传成功后，由监护人登录深圳市社保局网站补录个人信息，打印《深圳市少儿医疗保险信息登记表》，并提供所需材料交至学校办理，经学校受理并初审后报社保机构审核。非在园在校深户少儿办理首次参保手续，由监护人登录深圳市社保局网站进行办理。
大学生办理首次参保手续，先通过学校(协办单位)上传学生信息，上传成功后由本人登录深圳市社保局网站补录个人信息，打印登记表，并提供所需材料交至学校办理，经学校受理并初审后报社保机构审核。此外市民比较关注的问题，比如首次参保的少儿与大学生如何缴费、已参保的少儿与大学生如何办理缴费手续、参保少儿及大学生如何绑定就诊社康中心或医院等问题，该局网上《深圳市少儿与大学生医疗保险问答》都一一作出了详细的解答。