首先,所有新生儿用的药均应由医生开出处方,切不可凭以往给其他人用药的经验给新生的小婴儿用药。此外,前面的章节已经提到过,出生2周以内的新生儿和早产儿口服给药的吸收量不确切；肌肉注射吸收亦不完全,因此,这些新生儿和早产儿患病时应及时去医院就诊,必要时给予静脉用药。
对于年龄较大的新生儿（大于2周）,可以给口服药。但用药的方式方法非常重要。药物无论是片剂还是粉剂,都要用温开水溶为液体状服用。因此,某些要在小肠内溶解吸收的药（即：肠溶剂）就不适合新生儿服用。由于这些药物或是对胃有较大的刺激,或是在小肠吸收更好,因此,这些药物都外包特殊的胶囊或外壳,服药时应整粒吞咽,药物达到小肠时才溶解吸收,而新生儿是不可能整粒吞药的。
喂药时应将婴儿抱起,将药放入奶瓶内喂服或用小勺缓慢从一侧口角喂入,切忌强行灌药,以免呛咳和误吸入气管内。喂完药后再喂少量温开水,使药物能够更完全地喂进去。并且一定要遵照医嘱,按时按量用药,切不可随意增加药量。直肠给药在新生儿很少应用。外用药在新生儿使用也要注意安全,因为新生儿皮肤角化层薄,毛细血管较丰富,体表面积相对较大,药物经皮肤吸收较成人迅速和广泛,尤其在皮肤有炎症和破损时。
因此,新生儿外用药也要有医生的指导,严格掌握剂量,避免大面积皮肤涂药,否则,有些药物经皮肤粘膜吸收过多,也可以发生中毒反应。总而言之,给新生儿用药应更加慎重,否则,不但不能达到治病的目的,反而可能给孩子造成其他的损害。