1.经营目标不同。商业保险以追逐盈利为最高目标,存款保险以金融稳定为根本利益。存款保险在保护存款及其储户的同时,通过对存款性金融机构提供资金支持的方法,保证了金融危机时金融机构的持续经营。之所以要对金融机构提供如此保护,是因为不同于财产保险合同的双边性质,存款保险涉及三方。Kane（1995）将存款保险比作保证契约（bondingOrsuretycontract）。他认为储户和存款性金融机构分享了保证担保的利益。就储产而言,其资金得到了保护；就金融机构而言,它受到了信贷支持、降低了资本成本、避免了挤兑造成的营业中断。除此之外,其他的利益团体（如监管部门及政治团体）也或多或少地得益于存款保险,他们通常为追求自身利益,对存款保险构成不利。
2.传播机制不同。商业保险不会受到独立事件的负面影响,尤其是不可抗力等,然而存款性金融机构的失败通常不是孤立的事件,它会形成一个浪潮。这一浪潮形成的原因各异,可能是严重的经济衰退；可能是宏观经济面的不稳定；可能是监管措施不当；也可能是经营失利“传染”（contagious）所致。
3.保险对象不同。商业保险通常涉及两方——被保实体、承保人。但存款保险合同却涉及三方当事人。即存款保险机构、存款人和存款性金融机构。
4.保险险种不同。商业保险品种多样,存款保险险种单一,除合格存款外』9无其他。
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