信息的加工处理是从信息原材料到信息产品的加工制造过程,包括信息的预处理（信息的分类、编码、校验、汇总等）和深加工（运用数理统计方法对信息进行深度加工处理,如参保信息分析、财务经济预测、医疗服务问题研究等）,其最终目的是为用户提供高质量的信息产品。
在医疗保险信息系统中,需要加工处理的信息大致有：基本信息、医疗信息、财务信息、服务监督信息和信息的储存。
1.基本信息的加工处理。参保和证件管理信息是基本信息,处理的主要任务是根据采集到的基本信息形成各种统计表格,包括：
（1）参保人的年龄、性别分布情况；
（2）参保人数、单位数和缴费工资情况；
（3）注销、冻结证件情况；
（4）退保情况。
2.医疗信息的加工处理。对采集到的医疗费用数据进行分析和检验,对明显不合理的数据进行调查,并向有关部门报告,核实无误后再进行汇总,并形成若干报表,包括：
（1）每名参保人详细的卫生所、医疗门诊、住院、现金报销费用表；（2）医疗保险门诊费用、大型门诊仪器费用日报表、月报表、汇总明细表及偿付结算月表；
（3）医疗保险住院费用、大型住院仪器费用日报表、月报表、汇总明细表及偿付结算月表；
（4）各定点医疗机构医疗保险费用结算月表；
（5）医院、卫生所医疗保险偿付结算汇总月表；
（6）医疗保险门诊、住院、大型仪器检查治疗费用、现金核销日报表；（7）医疗保险现金核销汇总月表；
（8）医疗保险偿付汇总月表；
（9）卫生所医疗保险门诊费用总工程师表；
（10）医疗保险门诊费用总表；
（11）医疗保险住院费用总表。
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