基本医疗保险费用的结算方式，应根据社会保险经办机构的管理能力以及定点医疗机构的不同类别确定，可采取总额预付结算、服务项目结算、服务单元结算等方式。也可以多种方式结合使用。
采取总额预付结算方式的，要根据基本医疗保险的给付范围和参保人员的年龄结构，合理确定对定点医疗机构的预付总额。同时，要通过加强监督检查，防止为降低医疗成本而减少必需的医疗服务，确保参保人员获得基本医疗保险规定的、诊疗疾病所必需的、合理的医疗服务。
采取服务项目结算方式的，要根据医疗服务的收费标准和基本医疗保险服务管理的有关规定以及服务数量等进行结算。同时，要加强对医疗服务项目的监督和审查工作，防止发生大额处方、重复检查、延长住院、分解诊疗服务收费等过度利用医疗服务的行为。
医疗保险费用结算采取哪些方式 ？
（一）门诊大病（第一类）综合医疗保险门诊、定点零售药店一般基本医疗费用和地方补充医疗费用按服务项目结算；
（二）住院医疗保险、农民工医疗保险门诊基本医疗费用按绑定参保人数定额包干；
（三）门诊大型医疗设备检查和治疗费用按核定的门诊次均费用偿付标准结算；
（四）门诊血透基本医疗费用和地方补充医疗费用按有关协议规定的费用偿付标准总额结算；
（五）生育医疗保险参保人产前检查的基本医疗费用按服务项目结算；
（六）一般住院基本医疗费用和地方补充医疗费用按服务单元并结合住院门诊人次比标准结算；
（七）部分病种或治疗项目的住院基本医疗费用和地方补充医疗费用按病种费用偿付标准结算；
（八）长期住院的精神分裂症病人的住院基本医疗费用和地方补充医疗费用按年度包干结算；
（九）参保人住院发生的基本医疗保险、地方补充医疗保险费用超过医院住院平均费用偿付标准4倍以上的，单独偿付，其中90%按服务项目结算，10%按服务单元结算;医院住院平均费用偿付标准4倍以下的费用，按服务单元结算；
（十）其他费用结算按协议约定的方式结算。
采取服务单元结算方式的，可以诊断病种、门诊诊疗人次和住院床日等作为结算的服务单元。具体结算标准可按同等医疗机构的服务单元的平均消费剔除不合理因素后确定，并根据物价指数进行适时调整。同时，要加强基本医疗保险管理和费用审核，防止出现推诿病人、分解服务次数等现象。