从2009年4月6日开始，新医改转入施行阶段，而“推进公立医院改革”也成了新医改方案的重中之重，作为医疗卫生服务终端的公立医院，集各种矛盾和问题于一身，成为医改绕不开的“堡垒”。2015年国务院办公厅印发《关于城市公立医院综合改革试点的指导意见》提出，2015年进一步扩大城市公立医院综合改革试点。到2017年，城市公立医院综合改革试点全面推开。
为响应国家有关部门号召，深入推进呼市公立医院综合改革，扩大改革覆盖面和群众受益面，呼市全面推进公立医院改革。
扩面提标，整体推进各项改革
全面推开县级公立医院综合改革，将旗县区公立综合医院和中蒙医院全部纳入改革范围，同时积极探索公立医院管理体制和运行机制综合改革，以基础条件较好、改革稳步进展的托县医院、和林县医院、武川县医院为重点，在取消药品加成的基础上全面推进法人治理结构、人事聘用、绩效评价、薪酬分配等综合改革，深入推进城市公立医院改革。
建立公立医院运行新机制
改革公立医院法人治理机制，以理事会、监事会和院长负责制为主要内容，取消医院行政级别，建立有利于举办主体、管理层、监督者权力运行的新模式。建立现代医院人事用工制度，进一步扩大医院的人事管理自主权，健全医院人事管理的自我约束与发展机制。
推进公立医院医药分开，破除以药补医
纳入试点范围的17家公立医院自5月1日起全部取消药品加成，实行零差率销售。同时合理调整医疗服务价格，按照总量控制、结构调整、有升有降、逐步到位的原则，对公立医院的一般检查治疗费项目、临床诊疗费、手术治疗费、中医治疗费、大型设备检查和临床检查费等项目进行合理调整，逐步理顺医疗服务比价关系。
建立以病人为中心的分级诊疗模式
明确基层医疗卫生机构、县级医院、三级医院的功能定位，综合运用医疗、医保、价格等手段促进各级各类医院各司其职、分工协作。
合理规划，完善医疗服务体系
研究制定十三五期间呼市和各旗县区卫生发展规划和医疗机构设置规划，合理确定公立医院功能、数量和规模，构建公益目标明确、布局合理、规模适当、结构优化、层次分明、功能完善、富有效率的公立医院服务体系，年底前要完成两个规划的制定。落实各项政策，鼓励和引导社会资本办医，在医疗机构设置规划中给非公立医院留出足够空间，保证非公立医院的健康发展，5月底出台鼓励和引导社会资本举办医疗机构的实施意见。