较强的厄尔尼诺和拉尼娜事件在夏季以前结束后,由于大气对海洋的响应还会持续一段时间,这种滞后效应也会使当年的台风活动受到影响,如1997年5月发生的20世纪最强的厄尔尼诺事件,虽然在1998年5月结束,但除了1997年生成和登陆的台风数偏少外,1998年生成的台风仅为12个,为解放以来最小的一年。
在厄尔尼诺年和拉尼娜年,台风生成的位置和强度也有显著差异。在厄尔尼诺年,台风生成的年平均位置比拉尼娜年偏南1．6个纬度,偏东3个经度,中心最低海平面气压年平均值比拉尼娜年低4．5百帕,台风中心附近最大风速年平均值偏高2．6米／秒。也就是说厄尔尼诺年比拉尼娜年台风生成的平均位置偏南偏东,强度偏强。
厄尔尼诺和拉尼娜对台风影响的差异,究其原因,与海洋和大气环流形势有关。在厄尔30 中国财产保险重大灾因分析报告(2006)尼诺年,赤道东太平洋海温增高,热带西太平洋海温偏低,在西北太平洋,提供给大气的热量和水汽减少,太平洋低纬地区对流活动减弱,这是不利于形成台风所需的低层辐合、高层辐散的环流条件,因此在厄尔尼诺年台风活动减少。而在拉尼娜年,赤道东太平洋海温降低,西太平洋海温升高,使西北太平洋对流加强,有利于热带扰动发展,因此台风活动增强。