内部纳税检查是纳税人内部的独立部门或人员对应纳款的计算、核算、缴纳情况等所进行的检查。它具有检查账目错弊、规范税务管理、提高企业生产效率的作用。内部纳税检查作为一种内部监督制度,通常采用下列方法：
详查法
即对所有会计资料进行逐一检查c其特点是检查内容多、范围广、耗费人力和时间较多。此法适用于对财务管理比较混乱的企业进行检查。
抽查法
即以点代面,有重点的进行检查。其特点是重点突出、省时省力,但抽样易造成遗漏。
顺查法
即按照会计业务进展顺序检查。其特点是检查思路较为系统、遗漏较少,但工作量也较大。
逆差法
即按照会计业务进展逆序检查。其特点与顺查法相似。
比较分析法
即将企业与纳税相关的资料按历史水平、计划指标、同行业指标等进行纵向、横向分析比较,以达到纳税检查的目的。
内部纳税检查重点
由于企业所纳税种繁多,因此,纳税检查的内容比较复杂,那么应着重检查那些方面呢？一般应从如下几个方面入手：
计说依据是否真实可靠,包括对会计资料真实性进行检查和对纳税调查项目真实性进行检查。
所用税率是否合法适当,包括对比例税率的检查、对累进税率的检查和对单位税领的检查。
对缴纳税款的检查。
年末税款汇总清算或结算的检查。
对纳税减免的合法性进行检查。