管理费用是保险经办机构开展业务活动、维持正常运营所需要的各种费用,主要包括管理人员的工资及劳务补贴、办公费、差旅费、宣传费、保险证件的印制费、财产的折旧及维护费等。理论上,影响管理费用的主要因素有：
一是保险覆盖面。一般地,保险规模越大,投保人数越多,则管理费用占保险费比例越小,反之亦然,但以不超过保险费的10％为宜。新开展医疗保险的统筹地区,可参考基本情况类似的、已开展地区的标准进行制定；已开展医疗保险的统筹地区,可以根据上年度实际管理费水平进行估算。
二是保险管理体制。一般地,从管理成本来看,进行统一管理的社会医疗保险的管理成本会大大低于分散经营的管理成本。
三是保险项目的性质。例如,医疗费用较高的住院服务项目、长期性慢性非传染性疾病的管理成本会远远高于普通门诊服务项目。
四是管理方式。在实际管理过程中,采取宏观管理为主、微观管理为辅的管理方式的成本会远远低于完全采取微观管理方式的成本。并且,前者的管理效率较高,控制医疗费用不合理增长的管理效果也较佳。
需要指出的是,按照有关规定,参照全额预算进行管理的医疗保险经办机构,由于人员的工资、奖金、福利、办公设施、具体工作经费和办公经费均纳人当地政府的财政预算范围之内,故从严格的意义上讲,其不应该再提取任何管理费用；对于参照差额预算管理的医疗保险经办机构,可以根据实际情况,酌情提取一定比例的管理费用用于弥补相关经费的不足。